Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VrtnQ3SYK4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms