Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psd3Q2PFD7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psd3Q2PFD7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psd3Q2PFD7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms