Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samd11Q1RNF8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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