Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms