Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd12Q0VE29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms