Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms