Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata18Q0P557 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms