Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrioQ0KL02 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms