Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2bQ0KL01 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms