Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chd8Q09XV5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chd8Q09XV5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms