Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms