Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms