Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms