Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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