Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MestQ07646 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MestQ07646 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MestQ07646 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MestQ07646 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MestQ07646 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MestQ07646 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MestQ07646 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms