Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms