Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1bQ06985 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms