Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms