Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a1Q05722 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms