Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms