Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms