Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms