Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RelaQ04207 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RelaQ04207 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms