Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgfr4Q03142 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr4Q03142 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms