Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NfiaQ02780 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms