Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctnnb1Q02248 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms