Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms