Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EgfrQ01279 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms