Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms