Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a1Q00780 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col8a1Q00780 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms