Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms