Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PgrQ00175 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms