Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb4P99026 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb4P99026 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms