Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cds1P98191 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms