Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brca2P97929 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brca2P97929 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brca2P97929 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brca2P97929 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brca2P97929 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms