Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp6P97868 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms