Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cry1P97784 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cry1P97784 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cry1P97784 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cry1P97784 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cry1P97784 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cry1P97784 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms