Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2cP97760 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms