Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms