Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx3-1P97436 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx3-1P97436 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms