Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LystP97412 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LystP97412 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LystP97412 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LystP97412 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LystP97412 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LystP97412 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LystP97412 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LystP97412 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LystP97412 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LystP97412 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LystP97412 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LystP97412 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LystP97412 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LystP97412 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LystP97412 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LystP97412 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LystP97412 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LystP97412 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LystP97412 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LystP97412 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms