Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig3P97386 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig3P97386 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig3P97386 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms