Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Meis3P97368 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms