Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx2-3P97334 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-3P97334 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms