Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkdcP97313 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms