Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl21bP86792 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl21bP86792 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms