Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Q6P79568 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Q6P79568 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms