Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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