Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgif1P70284 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms