Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdlim4P70271 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms